Melanotan II on synteettinen analogi -melanosyyttejä- stimuloivalle hormonille (-MSH), joka on peptidihormoni.

Melanotan II:n kiinteän -faasin synteesimenetelmälle on tunnusomaista seuraavat vaiheet: ensin käytetään Fmoc-linkkeri-aminometyylihartsia kantajana; sitten kytketään aminohapot peräkkäin Fmoc/tBu kiinteän -faasin peptidisynteesimenetelmän mukaisesti ja suoritetaan asetylointi; sen jälkeen trifluoriasetyyli- ja metyyliesteriryhmien poistaminen aminohapoista hydrolyysillä käyttämällä 1–2 N NaOH-liuosta ja dioksaania (NaOH:n ja dioksaanin tilavuussuhteessa 1:1-1:4); sitten suoritetaan syklisointi suoraan hartsille käyttämällä kondensointiainetta; ja lopuksi peptidin lohkaiseminen hartsista käyttämällä trifluorietikkahapon, veden, tioanisolin ja 1,2-etaaniditiolin seosta suhteessa 92,5:2,5:2,5:2,5. Saatu raaka Melanotan II puhdistetaan ja muunnetaan asetaattisuolaksi preparatiivisella HPLC:llä, mitä seuraa pakastekuivaus, jolloin saadaan Melanotan II -asetaattia. Käytettäviä aminohappoja ovat Fmoc-Lys(Tfa)-OH, Fmoc-Trp(Boc)-OH, Fmoc-Arg(Pbf)-OH, Fmoc-D-Phe{{{0} Fmoc-His(Trt)-OH, Fmoc-Asp(OMe)-OH ja Fmoc-Nle-OH.